【罕見病檢查】港大醫學院研究：羊水細胞RNA測序有助產前診斷罕見病基因

By Giann on 29 Dec 2022

Deputy Managing Editor

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在香港中，每67人就有1人患上罕見病。港大醫學院臨床醫學學院兒童及青少年科學系及婦產科學系臨床研究發現，利用準媽媽懷孕16至24週期間獲得的羊水細胞作為新型樣本，用於產前診斷中的RNA測序，將有助更多家庭診斷出未確診的罕見病，從而進行更精準的臨床醫療管理。這是文獻中第一個證明羊水細胞RNA測序潛在臨床效用的概念驗證研究。

Photo from 港大醫學院

罕見病的病因一般涉及遺傳因素，根據團隊早前的研究，縱使個別罕見病相對地稀有，但在香港人口中，每67人就有1人患上罕見病。正確診斷罕見病的遺傳因素可以為準父母提供精準的諮詢，從而獲得更好的臨床管理，為未來的懷孕計劃作合適的準備，對支持患者或準父母至關重要。目前的產前診斷主要基於DNA檢測技術，但其中大部分 (60-70%) 的罕見病未能診斷出來，臨床診斷的不確定性會為準父母帶來焦慮。近年已發現的RNA測序能將罕見病的診斷率提高 10% 至 36%；然而，這些研究都沒有涉及產前診斷。

此外，儘管有完善的大型數據庫提供成人不同組織的RNA表達譜編目，現時仍然缺乏反映胚胎及胎兒階段（例如羊水細胞）RNA表達譜的公開數據集。因此，有必要進一步研究針對產前診斷中的RNA測序。

研究發現羊水細胞RNA測序有助診斷罕見病基因

是項研究展示了羊水細胞RNA測序潛在的臨床效用。首先，團隊以50多個羊水樣本進行RNA測序，建立了羊水細胞RNA表達譜的基線。建立RNA表達譜基線是將 RNA 測序應用於當前選定的臨床診斷流程中重要的步驟。研究發現羊水細胞中表達良好的基因數量與通常用於基因診斷的舊有樣本類型，有相似的表達譜。

團隊繼而比較了四個受先天結構異常影響的胎兒RNA測序數據與既定基線，以檢測潛在的異常值。研究團隊與德國慕尼黑工業大學合作，優化了生物計算方法，以增強對異常值檢測的敏感度。研究進一步證實了在所有受影響的胎兒中，可以在與相應先天結構異常相關的基因中識別出異常值；識別異常值可以在RNA水平上提供更多證據來協助診斷。

Photo from 港大醫學院

對解決未確診的罕見病具有重要意義

這項研究的結果對解決未確診的罕見病具有重要意義。這是文獻中首次報導羊水細胞RNA測序在產前診斷中具有潛在的臨床應用價值。通過確定診斷遺傳因素，可以為病人帶來更精準的醫療，有助有家族病史的病人進行有關胚胎植入前的基因診斷。

是項研究在美國人類遺傳學協會 (ASHG) 的2022周年大會上獲選為「評論家之選（學術論文海報文摘前10%）」。這個周年大會專家雲集，是同類會議中規模最大的會議之一。港大醫學院臨床醫學學院兒童及青少年科學系臨床遺傳學家及臨床副教授鍾侃言醫生表示，非常榮幸港大醫學院的研究在這個享有盛譽的國際會議上獲選為海報摘要的前10%。 RNA測序在解決無法解釋的遺傳疾病方面具有巨大潛力，他們會繼續加強與海內外及本地機構的聯繫與合作，為國際科學研究作出貢獻，同時為病人及市民大眾的健康福祉努力奮進。

港大醫學院臨床醫學學院婦產科學系名譽臨床副教授簡適悠醫生暨贊育醫院產前診斷化驗室副主任補充，今年適逢贊育醫院成立一百週年，這項研究展現了贊育醫院在過去一個世紀為香港提供了卓越服務，他們承諾會繼續努力推動創新研究，為大眾同創健康未來。

相關突破研究成果已於國際權威科學期刊《npj基因組醫學》發表。

是項研究由港大醫學院臨床醫學學院兒童及青少年科學系臨床副教授鍾侃言醫生、港大醫學院臨床醫學學院婦產科學系臨床副教授簡適悠醫生聯合領導。鍾醫生團隊的碩士研究生李蜜茵與助理研究主任鄺嘉儀博士同為第一作者。其他參與本項研究的學者包括：港大醫學院臨床醫學學院兒童及青少年科學系麥駿宇博士、崔文俊及周晃霆；港大醫學院臨床醫學學院婦產科學系陳遠光博士、歐良娟博士及盧熙旼。國際團隊則有德國慕尼黑工業大學信息學系Julien Gagneur 教授及 Vicente A Yépez 博士。